ds 2020版本新功能介绍在线讲座-j9九游会真人游戏第一

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2020年3月 | ds2020版本新功能介绍在线讲座
来源:计算模拟平台

讲座主题 2020版本新功能介绍

讲座时间:2020年3月6日(周五),下午14:00

主讲人:罗芳(产品j9九游会真人游戏第一的技术支持,生命科学部门)

注册地址:

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讲座内容

分子动力学模拟

  • 新增multi-site lambda dynamics method(msld):用于计算大型类属库分子的相对结合自由能,更好地进行先导化合物的筛选优化;且可以用gpu计算;


图片1.png

图1:通过msld方法计算组合库中分子的相对结合自由能


  • 新增显式膜结构的跨膜蛋白的分子动力学计算。提供多种类型的磷脂膜结构,同时支持自定义膜类型。

图片2.png

图2:在popc显式膜内溶剂化的herg离子通道


抗体理性设计

  • 新增计算抗体黏度,蛋白溶解度;

  • 优化predict humanizing mutations protocol(抗体人源化计算)参数,可以同时自定义重链(h)和轻链(l)的v基因和j基因。


药效团

  • 新增ensemble pharmacophore generation:从一组活性配体生成一组共同特征的药效团。活性配体使用2d指纹进行聚类。对于每个聚类,从聚类中心选择5个配体,然后使用共同特征药效团算法创建药效团;

  • 新增interaction pharmacophore generationprotocol:从受体-配体复合物的非键相互作用出发产生药效团模型。


第三方程序的更新

  • charmm版本更新至c43b2

  • modeler版本更新至v9.22

  • dmol3版本更新至v2020

  • 抗体模板库更新至2019年7月


与最新发布的biovia 2020相兼容

若您想对以上新功能做进一步了解和获取更多 2020新功能信息,点击下方按钮报名参加discovery studio 2020在线发布会!  


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